Pokemon Best Wishes adalah
ash (Satoshi) di isshu island. Yap, new place, new friend, and new pokemon.
Sesudah ash menyelesaikan liga Shino, maka berakhirlah petualangan ash bersama
down/ hikari (pokemon koordinator) dan brock / takeshi (Pokemon Breder). Cerita
bermula ketika ash berlibur bersama ibunya dan profesor Okido ke Pulau Isshu,
pada saat pertarungan dengan team rocket , langit tiba-tiba menjadi gelap dan
ada guntur ke arah pikachu yang menyebabkan pikachu tidak bisa mengeluarkan
kekuatan listriknya lagi. Menurut kepercayaan orang Isshu, ini adalah ulah
pokemon legendaris Zekrum. Pada saat pikachu diperiksa di laboratoriom araragi,
langit kembali gelap dan petir menyambar ke pikachu lagi, dan mengembalikan
electrity pikachu.
Sesudah itu ash memutuskan
bertualang menjelahi di Pulau Isshu karena tertarik melihat banyaknya perbedaan
antara pokemon di Isshu dibandingkan dengan pokemon yang pernah ditemui
sebelumnya saat di johto, shino.
